喜报|浙江林业科学研究院与艾斯博检测合作在保育遗传领域取得新进展

发布时间：2023-06-02阅读：8283

6月1日，进化与群体遗传学领域国际学术期刊《FrontiersinGenetics》（JCR：Q1，IF2022=4.772）在线发表了浙江林业研究院湿地创新团队题为“PopulationGeneticAssessmentofViburnumjaponicuminChinausingddRAD-seq”（DOI:10.3389/fgene.2023.1150437）的研究论文。

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2023.1150437/full?utm_source=F-NTF&utm_medium=EMLX&utm_campaign=PRD_FEOPS_20170000_ARTICLE
论文原文链接

首次应用艾斯博检测技术有限公司提供的简化基因组测序技术揭示了中国大陆分布的濒危海岛特有植物日本荚蒾种群遗传特征及维持机制。

日本荚蒾（Viburnumjaponicum）亦称海岛荚蒾，为五福花科（Adoxaceae）荚蒾属（Viburnum）常绿灌木或亚乔木。是一种特产于东亚的海岛特有植物，在中国大陆，其野生种群仅分布在浙江省东部沿海零星岛屿（舟山和台州）。由于分布区狭小、数量稀少，且因生境特殊面临潜在威胁，它已被列入《浙江省重点保护野生植物名录》（第一批）和浙江省极小种群保护物种，也是一个开展保育遗传学和岛屿生物地理学研究的理想材料。

在前期研究基础上，团队成员对该种在浙江省所有已知野生分布点进行了居群取样，并利用艾斯博检测提供的新一代简化基因组测序技术（Doubledigestrestriction-siteassociatedDNAsequencing,ddRAD-seq）开展种群基因组学的研究。基于筛选出的445,060高质量单核苷酸多态性位点（SNPs），开展系统发育ML树重建、ADMIXTURE遗传结构分析、PCA分析、AMOVA分子方差统计、Mantel和TreeMix检测的综合分析。结果显示，当前野生日本荚蒾具有中等水平的遗传多样性和显著遗传分化，其遗传结构格局的形成主要受其岛屿分布格局和自交特性的影响；与台州种群相比，舟山种群检测出更高的遗传多样性水平；历史基因流检测到岛屿之间存在一个迁徙事件。据此推测，日本荚蒾果实经鸟类随机传播扩散，有助于维持其种群在岛屿间的基因流动。研究结果为深入了解日本荚蒾的多样性维持的遗传机制和种群历史提供了见解，同时，也为浙江省极小种群植物资源的保育和管理提供了依据。

湿地生态创新团队朱弘博士为第一作者，2023届林业专硕研究生柳娟为第二作者，高美蓉高工和李贺鹏副研究员为共同通讯作者。该研究工作得到了浙江省省属科研院所扶持专项（2022F1068-3和2021F1065-6）的资助。

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